学校认真贯彻“科教兴国”战略，强化“人才培养、科学研究、社会服务、文化传承与创新、对外交流与合作”五大职能，抓重点、创特色、上水平，深化科研管理体制改革，不断加大科研工作力度和经费投入，加强科研创新平台和科研创新团队建设，积极开展学术交流活动。学校实施“一流学科建设计划”、“1355科技创新工程”，不断强化优势特色，加强学科建设，现拥有生态学、应用数学等7个省级重点学科以及航空宇航科学与技术、交通运输、生态学、材料与化工、资源与环境等10个校级一流学科。

        学校现拥有各级各类科研创新平台52个、（社）科普教育基地27个，建有校直属科研机构3个；获批建设省高校优秀青年创新团队15个。近五年，立项国家级课题50项、省部级课题218项、横向课题1012项，发表SCI、SSCI、CSSCI等高水平学术论文212篇，出版著作261部，获授权发明专利205项；获省部级科研成果奖8项，获重要社会力量科研成果奖14项。举办航空类学术会议6场，邀请校外专家作“航空大讲堂”学术报告32场。《滨州学院学报》被评为“全国地方高校名刊”，“孙子研究”栏目入选教育部“名栏建设工程”。